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在投资方式中，假如我们有多种选择方式，比如说货币资金、存货、设备投资和无形资产投资任选的话，尽量选择后两种投资方式。值得注意地是，固定资产投资选择的方式不同，也会产生不同地税收成本。首先我们来看机器设备作为注册资本投入、房屋作为其他收入的情况。按规定，企业以设备作为注册资本投入，参与合资企业利润分配，共同承担风险，不征收相关税金；但把房屋直接作价卖给另一企业的行为，作为新企业的负债，不共享利润、共担风险，视同房屋转让，投资方应交纳营业税、城建税、教育费附加及契税（根据现行政策，企业以设备作投资，应视同销售要征收增值税、城建税及教育费附加）。其次我们再分析一下房屋作为注册资本投入、机器设备作为其他收入情况下应该如何纳税。房屋、建筑物作为注册资本投资入股，参与利润分配，承担投资风险，按税法规定，可以不征营业税、城建税及教育费附加，但需征契税（由受让方交纳），企业把自己使用过的机器设备直接作价给另一企业，视同转让固定资产，其售价一般达不到设备原价，可以不交增值税。我们下面用一个例子来说明上述问题。
某投资人（企业）以设备100万元（账面价格120万元）和房产100万元作投入与另一家企业组成合伙企业。当采取第一种方式时，投资人（企业）负担的税款为：营业税5（万元）=100×5%；城建税、教育费附加5000元＝5×（7％＋3%）；契税3（万元）=100×3%（由受让方交纳）。
当采取第二种方式时，只需交纳契税3（万元）=100×3%。两种方式相比，投资人仅仅是改变了几个字的先后顺序，税收负担却降低了5.5万元。
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